名词解释—分子生物学
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分子生物学名词解释:
基因(gene):编码蛋白
质或RNA等具有特定功能产物的遗传信息的基本单位,是染色体或基
因组的一段DNA序列(对以RN
A作为遗传信息载体的RNA病毒而言则是RNA序列)。包括编码
序列(外显子)、编码区前后对于基
因表达具有调控功能的序列和单个编码序列间的间隔序列
(内含子)。
Tm值:Tm值就是
DNA熔解温度,指把DNA的双螺旋结构降解一半时的温度。不同序列的DNA,
Tm值不同。DNA
中G-C含量越高,Tm值越高,成正比关系。
中度重复序列(moderately
repetitive sequence )
:基因组中有10个到几千个拷贝的DNA
序列。重复单元的平均长度约300bp。
高度重复序列(highly repetitive sequence
):基因组中有数千个到几百万个拷贝的DNA
序列。这些重复序列的长度为6~200碱基对。
启动子(promoter ):DNA分子上能与RNA聚合酶结合并形成转录起始复合体的区域,在
许
多情况下,还包括促进这一过程的调节蛋白的结合位点。
增强子(enhancer
element ):增强基因启动子工作效率的顺式作用序列,能够在相对于启
动子的任何方向和任何
位置(上游或下游)上都发挥作用。
分子杂交(molecular hybridization
):不同来源或不同种类生物分子间相互特异识别而发
生的结合。如核酸(DNA、RNA)之间、蛋白
质分子之间、核酸与蛋白质分子之间、以及自组装
单分子膜之间的特异性结合。
限制性内切酶(restriction endonuclease)
:识别并切割特异的双链DNA序列的一种内
切核酸
酶。
反式作用因子(trans-acting factor ):通过直接结合或间接作用于DNA、R
NA等核酸分子,
对基因表达发挥不同调节作用(激活或抑制)的各类蛋白质因子。
半保留复制(semiconservative replication ):DNA复制时亲代D
NA的两条链解开,每条
链作为新链的模板,从而形成两个子代DNA分子,每一个子代DNA分子包含
一条亲代链和一
条新合成的链。
PCR(Polymerase Chain
Reaction ):聚合酶链式反应 ,聚合酶链式反应(PCR)是体外酶促
合成特异DNA片段
的一种方法,由高温变性、低温退火(复性)及适温延伸等几步反应组成
一个周期,循环进行,使目的D
NA得以迅速扩增,具有特异性强、灵敏度高、操作简便、省时
等特点。
Anticodo
n(反密码子):转移核糖核酸中能与信使核糖核酸的密码子互补配对的三核苷酸残
基。位于转移核糖核
酸的反密码子环的中部。
central dogma(中心法则):是指遗传信息从DNA传递给
RNA,再从RNA传递给蛋白质,即
完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA
,即完成DNA的复制过程。这
是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。
single-
strand binding protein(SSB单链结合蛋白):结合于螺旋酶沿复制叉方向向前推<
br>进产生的单链区,防止新形成的单链DNA重新配对形成双链DNA或被核酸酶降解的蛋白质。
Transcription(转录):是以DNA中的一条单链为模板,游离碱基为原料,在DNA依赖的<
br>RNA聚合酶催化下合成RNA链的过程。
Exon(外显子):是真核生物基因的一部分,它在剪接
(Splicing)后仍会被保存下来,并可
在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。
外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,
又称表达序列。
satellite DN
A(卫星DNA):真核细胞染色体具有的高度重复核苷酸序列的DNA。总量可占
全部DNA的10%
以上,主要存在于染色体的着丝粒区域,通常不被转录。因其碱基组成中GC
含量少,具有不同的浮力密度,在氯化铯密度梯度离心后呈现与大多数DNA有差别的“卫星”
带而得名。
c value:在每一种生物中其单倍体基因组的DNA总量是特异的,被称为C值
C值悖论(c-value paradox):高等生物具有比低等生物更复杂的生命活动,所以,理
论上
应该是它们的C值也应该更高。但是事实上C值没有体现出与物种进化程度相关的趋势。高
等生物的C值不一定就意味着它的C值高于比它低等的生物。这种生物学上的DNA总量的比
较和矛盾,
称为C值悖论。
Chromatin(染色质)
:真核细胞分裂间期的细胞核内由DNA、组蛋白、非组蛋白及少量RNA
组成的线性复合结构。
overlapping gen:
Denaturation(蛋白质变性):蛋白质在受
到光照、热、有机溶剂以及一些变性剂的作用时,
次级键受到破坏,导致天然构象的破坏,使蛋白质的生
物活性丧失。
autonomously replicating sequences( AR
S自主复制序列):在真核生物中发现的一类能
启动DNA复制的序列,含有一个AT富集区。最早在酵
母中分离得到,随后在其它真核生物
中也发现了ARS序列的存在。
core
promoter elements(核心启动子元件):真核生物基因启动子中介导基因转录起始的
最小的一段连续DNA序列。RNA聚合酶Ⅱ识别的启动子通常包含转录起始位点及其上游或下
游约35
个核苷酸的序列,大小约为40个核苷酸。含有TATA框,起始子(Inr),TFⅡB识别
元件(B
RE)和核心启动子下游元件(DPE)等序列模块。
Degeneracy(简并):两种或多种核苷酸三联体决定同一种氨基酸。
adaptive expression:
Intein:指蛋白质的内含子。 同mRN
A一样,一些前体蛋白质具有内含子(intein)序列,位
于多肽序列的中间,经加工切除后,两端
的蛋白质外显子 (extein)连接为成熟蛋白质分子。
Euchromatin(常染色质)
:间期核内染色质丝折叠压缩程度低,处于伸展状态,着色浅的那
部分染色质。富含单拷贝DNA序列,
有转录活性。
异染色质(heterochromatin ):间期核内染色质丝折叠压缩程度高
,处于凝聚状态,染料
着色深的那部分染色质。富含重复DNA序列、复制延迟,一般无转录活性。
jumping gene(跳跃基因或转座子transposon ):一段可以从原位上单独复制
或断裂下来,
环化后插入另一位点,并对其后的基因起调控作用DNA顺序.
Cot12:
Priming:
tRNA identity:
Tra
nslation(翻译):在多种因子辅助下,核糖体结合信使核糖核酸(mRNA)模板,通过转移
核糖核酸(tRNA)识别该mRNA的三联体密码子和转移相应氨基酸,进而按照模板mRNA信息依
次连续合成蛋白质肽链的过程。
constitutive heterochromatin(结
构异染色质):在细胞的所有时期都保持凝聚状态的染
色质。主要由高度重复序列DNA构成。
splitting gene(断裂基因):真核生物结构基因,由若干个编码区和非编码区互相间隔
开
但又连续镶嵌而成,去除非编码区再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质,这
些
基因称为断裂基因(splite gene)。
intragenenic promoter(
基因内启动子):位于转录起始位点下游的启动子。见于由RNA
聚合酶Ⅰ负责转录的5S核糖体核糖核
酸(rRNA)、转移核糖核酸(tRNA)等基因中。其中tRNA
基因的内部启动子区由两个10
bp元件的A框和B框组成。
isoaccepting tRNA(同功受体tRNA)摇摆假说
的相对性说明了摇摆范围的局限,在通用三
联体密码中一个密码子家族必须由两种tRNA识读。能解读
同义密码子的不同tRNA被定义为
同工受体tRNA。
Repression(阻遏):阻遏物或阻遏物-
辅阻遏物复合物与基因的调控序列结合而将其封闭,从
而阻止基因的表达。
Codon(密
码子):由3个相邻的核苷酸组成的信使核糖核酸(mRNA)基本编码单位。有64种
密码子,其中有
61种氨基酸密码子(包括起始密码子)及3个终止密码子,由它们决定多肽
链的氨基酸种类和排列顺序
的特异性以及翻译的起始和终止。
positive reg
ulation(正调节):调控因子(如转录、翻译的调控因子)等通过直接结合或间
接作用。引起激
活或增强基因表达的调控作用。可提高目的基因的转录效率以及基因产物的
数量或活性。
负调节(negative regulation ):转录、翻译或信号转导的调控过程被一些因子
(如阻遏蛋
白)所阻遏的调节方式。可使基因表达水平下降以及基因产物(RNA或蛋白质)的数量减少
。
leading
strand(前导链):与复制叉移动的方向一致,通过连续的5ˊ-3ˊ聚合合成的新
的DNA链。
后随链(lagging strand ):
与复制叉移动的方向相反,通过不连续的5ˊ-3ˊ聚合合成
的新的DNA链。
reverse transcription(逆转录):以RNA为模板,依靠逆转录酶的作用,以
四种脱氧核苷
三磷酸(dNTP)为底物,产生DNA链。常见于逆转录病毒的复制中。
facultative heterochromatin(兼性异染色质):生物体一定时期处于凝
缩失活状态的染色
质,而在其他时期松展为常染色质。
open reading fra
me(开放阅读框):是结构基因的正常核苷酸序列,从起始密码子到终止
密码子的阅读框可编码完整的
多肽链,其间不存在使翻译中断的终止密码子。
hyperchromic effect(增色效
应):核酸(DNA和RNA)分子解链变性或断链,其紫外吸收值(一
般在260nm处测量)增加的
现象。
Estein:
activating protein:(激活蛋白):抑制素
的两个β亚基组成的二聚体。是转化生长因子家
族的成员,β亚基有A,B 两种同工型,可形成AA、
AB、BB三种组合。除能刺激促卵泡激
素的分泌外,还有多种细胞生物效应。
Polys
ome(多核糖体):多个核糖体在一个信使核糖核酸(mRNA)分子上串成的颗粒体。信使
核糖核酸
在核糖体中有一段裸露的序列。每个核糖体可以独立完成一条肽链的合成。
Topoisomera
se(拓扑异构酶):是指通过切断DNA的一条或两条链中的磷酸二酯键,然后重
新缠绕和封口来更正
DNA连环数的酶。拓扑异构酶Ⅰ、通过切断DNA中的一条链减少负超螺
旋,增加一个连环数。某些拓
扑异构酶Ⅱ也称为DNA促旋酶。
replication fork(复制叉):正在进行复制的
双链DNA分子所形成的Y形区域,其中,已
解旋的两条模板单链以及正在进行合成的新链构成了Y形的
头部,尚未解旋的DNA模板双链
构成了Y形的尾部。